印度尼西亚（下文简称印尼）曾经历过大规模的地方分权运动，这也导致了其领土治理结构产生了变化。领土是可实施非均质治理的对象，地方分权是改变国家领土治理结构的重要影响因素。本研究在对地方分权与领土变化进行理论梳理的基础上，揭示了印尼地方分权下领土治理结构的变化。研究发现：第一，印尼地方分权后地方政府权责进一步提高，成为领土治理的重要主体；第二，领土碎片化、领土自治以及领土独立是印尼地方分权后最为典型的三种领土治理形式；第三，印尼领土治理形式是动态变化的，也是央地博弈形成的结果，不同类型的治理形式共同构成了印尼的领土治理结构。